Santé publique (2018-2019) - Arnaud Fontanet Collège de France

Arnaud Fontanet
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Santé publique (2018-2019)
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Chaire créée avec le soutien de Santé Publique France.

Comment sont faites les études épidémiologiques ?

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La première épidémie connue liée au virus Ebola remonte à 1976. Elle survient à une époque où l'on pensait les maladies infectieuses vaincues, au moins dans les pays industrialisés, grâce aux progrès de l'hygiène, aux antibiotiques, et aux vaccins. Ebola, puis le SIDA quelques années plus tard, nous montrent que l'on n'en a pas fini avec les maladies infectieuses : ainsi nait le concept des maladies émergentes. La maladie liée au virus Ebola est particulièrement effrayante, du fait de ses manifestations cliniques à type de fièvre hémorragique, et du taux de mortalité très élevé qui lui est associé. De plus, les personnels soignants sont très exposés au risque de contracter la maladie. Ce cours retracera l'investigation de la première épidémie en 1976 au Zaïre, les recherches sur les réservoirs animaux en Afrique Centrale, puis les enseignements des dernières épidémies sur les méthodes de contrôle, les traitements, et les vaccins en cours d'expérimentation.

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Le virus Zika, nommé après la forêt ougandaise où il a été identifié en 1947, est longtemps resté une curiosité exotique. Transmis par les moustiques Aedes, il circule de façon endémique en Afrique sub-Saharienne et en Asie du sud-est, et semble bénin. En 2007, il apparait sur l'Île de Yap en Micronésie avant de gagner en 2013-2014 la Polynésie française. Là, il infecte plus de la moitié de la population, et va provoquer un nombre important de paralysies sévères appelées syndromes de Guillain-Barré. En 2015, lors d'une épidémie massive au Brésil, on constate que des enfants nés de mères infectées pendant leur grossesse souffrent d'anomalies neurologiques graves dont des microcéphalies. Ce cours expliquera comment les scientifiques ont collaboré pour démonter le lien qui existe entre le virus Zika et ces complications nouvellement décrites. Il explorera également les nouvelles méthodes de lutte proposées contre les moustiques Aedes, responsables non seulement de la transmission du virus Zika, mais également des virus de la fièvre jaune, de la dengue, et du chikungunya.

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L'Egypte est le pays qui connait l'épidémie d'hépatite C la plus importante au monde. On doit cette épidémie à la transmission du virus de l'hépatite C lors des traitements de la bilharziose par injections intraveineuses de sels d'antimoine pendant les années 1960 et 1970. Avec l'arrivée des premiers tests diagnostiques dans les années 1990, le gouvernement égyptien prend conscience de l'ampleur du désastre, alors qu'apparaissent cirrhoses et cancers du foie, complications tardives de l'infection. A suivi la mise en place d'un programme national de prévention et de traitement, et la production locale d'antiviraux génériques vendus en Egypte à des prix mille fois inférieurs à ceux des pays industrialisés. Depuis octobre 2018, l'Egypte a entamé une campagne nationale de dépistage portant sur 65 millions d'individus. Va-t-elle être un des premiers pays à éliminer ce fléau ?

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Le SRAS, ou syndrome respiratoire aigu sévère, a marqué les esprits. Ce fut d'abord la première grande pandémie du XXIe siècle. Son émergence est due au franchissement de la barrière d'espèces par un virus totalement inconnu dont le réservoir est la chauve-souris, et qui va infecter l'homme par l'intermédiaire des civettes palmistes masquées consommées dans les restaurants du sud-est de la Chine. Grâce aux progrès de la biologie moléculaire, il a été possible de retracer le parcours de ce nouveau virus qui a conquis la planète en quelques semaines. On ne sait toujours pas pourquoi l'épidémie s'est arrêtée après six mois. Espérons que nous saurons retenir les leçons de cette répétition générale qui préfigure les prochaines grandes pandémies.

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Comment juger de l'impact d'une pandémie ? Sur le nombre de pays touchés, le nombre de morts, le coût économique, la couverture médiatique ? Pourquoi le SRAS, avec 774 décès en six mois, soit moins que le SIDA ou le paludisme en une journée, a-t-il eu un tel retentissement planétaire ? Ce cours vous donnera quelques clefs pour mieux comprendre l'impact des pandémies. Le cours abordera également les nouvelles modalités de réponse mises en place pour faire face aux émergences infectieuses.