Informatique et sciences numériques (2019-2020) - Walter Fontana

Collège de France
  • 5,0 (1)
  • COURS
  • CHAQUE SEMAINE

Walter Fontana a étudié la chimie à Vienne où il a fini avec une thèse de doctorat basée sur une analyse numérique des caractéristiques intrinsèques au pliage de l'ARN. Il a continué avec ses recherches à Los Alamos et au Santa Fe Institute, au Nouveau Mexique, où il a développé un grand intérêt pour l'informatique, prisme permettant de comprendre la biologie. Il a passé un an à l'Institute for Advanced Studies à Princeton dans le programme de biologie théorique, puis il a rejoint le département de biologie des systèmes à la Harvard Medical School.

Épisodes

  1. 17/12/2019

    08 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 4 — L'acquisition de l'information biologique : Apprentissage avec systèmes moléculaires ?

    1 h 27 min

  2. 10/12/2019

    07 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 3 — Modélisation du traitement de l'information biologique III - Outils de raisonnement sur les systèmes d'interaction moléculaire : La quête de renseignements utiles Analyse statique et causalité

    1 h 29 min

  3. 03/12/2019

    06 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 3 — Modélisation du traitement de l'information biologique III - Outils de raisonnement sur les systèmes d'interaction moléculaire : La quête de renseignements utiles Analyse statique et causalité

    1 h 31 min

  4. 26/11/2019

    05 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 3 — Modélisation du traitement de l'information biologique III - Outils de raisonnement sur les systèmes d'interaction moléculaire : La quête de renseignements utiles Analyse statique et causalité

    1 h 22 min

  5. 19/11/2019

    04 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 2 — L'héritage de l'information biologique : Limites de transmission

    1 h 35 min

  6. 12/11/2019

    03 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 2 — L'héritage de l'information biologique : Limites de transmission

    1 h 19 min

  7. 05/11/2019

    02 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 2 — L'héritage de l'information biologique : Limites de transmission

    1 h 26 min

  8. 29/10/2019

    01 - La biologie de l'information – un dialogue entre l'informatique et la biologie

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 1 — La représentation de l'information biologique : Aspects statistiques du mappage des séquences aux structures ; le cas de l'ARN

    1 h 18 min

  9. 24/10/2019

    Leçon inaugurale - Walter Fontana : Le vivant et l'ordinateur : le défi d'une science de l'organisation

    Walter Fontana Collège de France Informatique et sciences numériques (2019-2020) Année 2019-2020 Auteur d'une centaine de publications, le Pr Walter Fontana mène des recherches, principalement aux États-Unis et en Europe, qui montrent que les théories qui sont à la base de l'informatique d'une part et la biologie d'autre part ont beaucoup de choses en commun, et que la confrontation des points de vue et des approches peut améliorer et changer notre compréhension du vivant. Théoricien et informaticien, il travaille principalement sur les problèmes posés par la biologie des systèmes. Il a contribué à développer kappa , qui est à la fois une plateforme et un langage de programmation informatique permettant de simuler le fonctionnement du vivant au niveau moléculaire et cellulaire, et qui se veut un puissant outil de recherche collaborative en réseau pour la biologie. La biologie des systèmes a émergé en réponse au très haut débit de production et au foisonnement des données liées aux aspects moléculaires de la biologie cellulaire. Ces données ont renforcé le besoin de comprendre comment un système formé d'une incroyable diversité d'assemblages moléculaires qui interagissent les uns avec les autres de manière asynchrone et autonome pouvait manifester un comportement cohérent. La biologie des systèmes vise à développer et à intégrer de nouvelles approches expérimentales et mathématiques dans la recherche de principes qui rendraient plus intelligible la nature des phénotypes cellulaires, améliorant notre capacité de contrôle de ces derniers. Cette poursuite est certes motivée par la nécessité pratique de prévenir des dysfonctionnements et de lutter contre des pathologies. Mais la démarche adoptée par le Pr Walter Fontana reflète aussi le besoin d'une perspective théorique indispensable pour penser la complexité de la cellule et de l'organisme et, par extension, l'évolution elle-même. Aussi dans son cours au Collège de France, le Pr Walter Fontana adoptera une perspective différente de celle traditionnellement utilisée dans le domaine de la « bioinformatique », qui est souvent confinée à l'analyse des grands ensembles de données. Le calcul sera abordé sous deux angles. D'une part, celui de la théorie du langage de programmation vu comme un cadre formel à l'appui de la modélisation de systèmes dynamiques complexes pertinents pour la biologie. D'autre part, celui du calcul vu comme un phénomène naturel et physique faisant partie intégrante des systèmes biologiques.

    1 h 10 min
  • 9 épisodes

À propos

Walter Fontana a étudié la chimie à Vienne où il a fini avec une thèse de doctorat basée sur une analyse numérique des caractéristiques intrinsèques au pliage de l'ARN. Il a continué avec ses recherches à Los Alamos et au Santa Fe Institute, au Nouveau Mexique, où il a développé un grand intérêt pour l'informatique, prisme permettant de comprendre la biologie. Il a passé un an à l'Institute for Advanced Studies à Princeton dans le programme de biologie théorique, puis il a rejoint le département de biologie des systèmes à la Harvard Medical School.

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