バイオステーションポッドキャスト Bio-station Podcast

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バイオステーションポッドキャストは研究やキャリア選択の裏側を可視化することを目指します。

  1. #21 Luck Bucks the Rules (ゲスト：岡崎朋彦先生 / 北海道大学准教授)

    JUL 6

    #21 Luck Bucks the Rules (ゲスト：岡崎朋彦先生 / 北海道大学准教授)

    北海道大学遺伝子病制御研究所准教授の岡崎朋彦先生をゲストにお呼びしました。学生から助教まで14年過ごした後藤由季子研究室での研究生活、15年越しのプロジェクトであるトポロジー反転による細胞質カルボキシル化、北大でのPI生活とこれからの展望などについてお話しました。(収録日2025.06.05) Shownotes: 岡崎朋彦研究室(北海道大学遺伝子病制御研究所分子細胞生物研究室) 岡崎さんのカルボキシル化の論文 バイステポッドキャスト古舘さん回(パート1, パート2)  *言及を忘れていましたが、岡崎さんと古舘さんは学部からの同期です。 馬渕先生 後藤由季子研究室 岡崎さんのASKの論文 一條秀憲先生 ASKがMAPKKK 一條研のASK1と2の使い分けの論文Azad Bonni 谷口維紹先生 河岡義裕先生 ペルオキシソームの論文 NUDT21の論文 MAVS同定の論文(の一つ)　 吉種光先生 TM4SF20のTopology論文 Jonathan Kipnis Kipnisの論文 北海道大学遺伝子病制御研究所 村上正晃先生

    1h 21m
  2. #20 Science x Startup: Terebra Therapeutics (ゲスト：古川夏輝さん/ジョンズホプキンス大学)

    JUN 2

    #20 Science x Startup: Terebra Therapeutics (ゲスト：古川夏輝さん/ジョンズホプキンス大学)

    ジョンズホプキンス大学から古川夏輝さんをゲストにお迎えしました。がん細胞を選択的に細胞死させるペプチドの発見とその改良、またそのペプチドによるアメリカでの起業などについてお聞きしました。(収録日2025.05.5) Shownotes: 坪山さん回 本田さん回 同期ゲスト(井上さん回、小坂元さん回) UJA 二本垣さん OSUとミシガン大学 古川さんの論文 古川さん所属ラボ(Aleksander S. Popel lab) アメリカンナイトGOLD

    1h 4m

  3. MAY 13

    #19 Channeling the Nobel Prizes (ゲスト：東原幸起さん/David Juliusラボ)

    UCSFのDavid Julius(TRPチャネルで2021年ノーベル賞)ラボでポスドクをされている東原幸起さんをゲストにお呼びしました。博士課程を過ごしたRoderick MacKinnon(Kチャネルで2003年ノーベル賞)ラボでの様子を含め、ノーベル賞受賞者のメンタリングスタイルやチャネル研究のトレンド、最近Publishされた東原さんの論文を含めた東原さんのご研究についてお伺いしました。(収録日2025.04.22) 東原さんResearch map 萩原さん(NeuroRadio) 濡木研究室 伏信研究室 David Gadsby先生  Hodgkin-Huxley論文 Roderick MacKinnonラボ DavidとYifanによるTRPチャネルの構造 Thomas Walz 東原さんの論文１ 東原さんの論文２　 共著の構造の論文 David Juliusラボ Yulong Liラボ Ardem Patapoutian Lab 東原さんの論文

    1h 15m
  4. #18 Decoding the non-coding genome (ゲスト：松本有樹修先生/名古屋大学教授)

    MAR 18

    #18 Decoding the non-coding genome (ゲスト：松本有樹修先生/名古屋大学教授)

    名古屋大学教授の松本有樹修先生をゲストにお呼びして、翻訳されるノンコーディングRNA、リボソームの多様性、中山敬一ラボでのPhD生活、ハーバード大学Pandolfi研での留学、これからの研究の展望などについてお話をお聞きしました。(収録日2025.03.11) Shownotes: 松本先生ラボHP 中山敬一先生 中山研での松本先生の論文(p57 1, 2: Fbx7 1, 2) Howard Chang HOTAIRの論文 John Rinn Pier Paolo Pandolfi 松本先生のSPARの論文 JmjC domain Dark Proteomeと呼ばれている Upstream ORFが翻訳されると下流の翻訳が抑制される(の例) 翻訳されている位置をより正確に検出する手法 PhyloCSF 翻訳されるノンコーディングRNAの論文(TINCR, KastorとPolluks) 鍋島陽一先生 Klotho遺伝子 C末端の疎水性と分解 元根さんのナノポアの論文 アストラル(質量分析器) 吉種先生 心筋リボソームの論文 胸腺プロテアソーム(Thym-Proteasome) 精巣特異的リボソーム Maria Barna先生のリボソーム多様性の論文

    1h 19m

  5. FEB 3

    #17 The Era of Protein Design (ゲスト：本田信吾さん/David Bakerラボポスドク)

    David Baker(2024年タンパク質デザインでノーベル化学賞)ラボでポスドクをされています本田信吾さんをゲストにお呼びしました。本田さんはアサヒビールを経て東大野地研で学位を取られ、その後現在のBakerラボに所属されています。今回は本田さんのこれまでのキャリアからタンパク質デザインの現在、本田さんの現在の研究などについてお聞きしました。さらにBakerラボの雰囲気やシアトルの生活の様子など研究以外のトピックも盛りだくさんでお届けします。(収録日2025.01.18) Shownotes: 野地研 本田さんの野地研での論文 デジタルバイオアッセイ David R. Walt Simoa (Degital ELISA) Alkaline Phosphataseのheterogeneousな画分を検出して診断に応用 David Bakerラボ プローブのデザイン 古賀先生　 David Agard Top7 古賀先生のデザイン原則 NAISTの小林先生 VILYA RoseTTAFold (Minkyung Baek et al.) RFdiffusion RoseTTAFold All-Atom AlphaFold 3 Boltz-1 Deepmindがenzymologistを募集している Serine hydrolasesのde novoデザイン Florian Praetorius Danny D. SahtoeとFlorianの論文 DynamicなHingeのデザイン Adam Broermanの論文 AlphaProteo BindCraft Kejia Wuが設計していた De novoデザインタンパク質で作られたCOVID-19ワクチン 分子デザインはじめました

    1h 43m

  6. JAN 16

    #16 Enhancers of Science and Life (ゲスト：牛木亜季さん/ワシントン大学セントルイスAssistant professor)

    今回はワシントン大学セントルイスで2025年から研究室を主宰されている牛木亜紀さんをゲストにお迎えしました。牛木さんは筑波大学・谷本研究室で学位をとられたのち、UCSFのNadav Ahituv先生の研究室でエンハンサーと疾患のかかわりで重要な成果を出されております。今回はこれまでの研究の背景やジョブハント事情、これからの牛木ラボの方向性などについてお聞きししました。(収録日2024.12.29) 牛木ラボHP 筑波大　谷本研究室 レニンの論文(1, 2) 進化しすぎた脳 生物と無生物のあいだ ミトコンドリア・ミステリー Nadav Ahituvラボ 牛木さんの無手足性の論文 牛木さんの側弯症の論文 井上詞貴先生 ヘビのCell Len Pennacchio, Axel Visel

    1h 14m

  7. 10/25/2024

    #15 Editing lives: Crafting Health and Future (ゲスト：小野隆一さん/UC Berkeley博士課程)

    UC BerkeleyのComparative Biochemistryで博士課程をはじめられた小野隆一さんをゲストにお呼びして、海外博士課程事情から最新のCRISPRや腸内細菌叢ゲノム編集などについてお話ししました。さらに豪華共同ホストとしてペンシルバニア大学博士課程の山田さんにご参加いただきました。(収録日2024.10.20) Shownote: 小野さんX(Twitter) 程久美子先生ラボ 程先生のmiRNA解説記事(2024.10.31まで無料公開) Brady Cress先生ラボHP Bredy先生のNature Microbiology論文 Bredy先生ラボの最近の論文 SVAP Peter J. Turnbaugh先生ラボHP  XPLANE Sam Sternberg先生の講義動画 CASTを見つけたPNAS論文  Defence island Anti-defence island(の例) Eugene V. Koonin先生ラボHP Jillian(Jill) Banfield先生ラボHP BORGの論文 Jennifer Doudna先生ラボHP Cas13の祖先の論文 Doudna研からのデリバリーの論文 Open CRISPR

    1h 1m

  8. 07/27/2024

    #14 Quality Control in Translation and Scientific Career (ゲスト：稲田利文先生(東京大学医科学研究所教授)

    東京大学医科学研究所教授の稲田利文先生をゲストにお呼びしました。博士課程の時分の大腸菌を用いた遺伝子機能ハンティングの研究から留学話に続いて現在の研究につながる翻訳異常に対するmRNAやタンパク質の品質管理機構などについてお聞きしました。(収録日2024.07.03) 稲田研究室HP 中村義一先生 稲田先生の博士論文 饗場弘二先生 留学中の論文(1, 2) Roy Parkerの論文 EMBO 2005の論文 RQCについてのレビュー(日本語) (1, 2)

    1h 13m
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