NeuroRadio NeuroRadio

定期ゲスト、デンマーク・オーフスの北沢太郎さん(@kitazawa_taro )。Neuro2024での記憶シンポジウムの宣伝、ラボ立ち上げから2年での進捗、初FENS参加など (7/11 収録)

Show Notes:


北沢さんラボ


Neuro2024のシンポ (2S06a, 7/25 木曜日 16:00-18:00, 第6会場)


Yingxhi Lin (“UTさうすうえすたん”ね。”てきさすさうすたん”てなんや...)


北村貴司さん


北西祐貴さん (後藤研メンバー)


Michael Greenberg御大


ERC


さきがけ (PRESTO)


LinのBiorxiv


Lin のNpas4 Cell 2020 論文


Sheena Josselyn / Paul Frankland


Sadegh Nabavi


伊藤夏穂さんのポスターは初日 (7 月24日午前 1P-179)


DANDRITE Scientific Advisory Board (SAB) Meeting


Greenbergの2014 (Malik et al.)


Seattle Hub for Synthetic Biology


Jay Shendureの論文(Choi et al., 2022)


Jesse Gray この人もGreenberg系列。一瞬独立してKCl-IEG実験(Tyssowski2018)とかやってたが気づけばなぜかAllenにいる。


Chao Sun


エリンシューマン


Anna Klawonn


米原さん


フィリッポ


オーフス大学


BGI


Greenberg Fos engram 論文 1, 2


Fens Kavli Network of Excellence


Ryohei Yasuda


Peter Scheiffele


Yang Dan


Ole Kiehn


FENS2024 ウィーン 


Alice Ting


Brain Conference


古館さん


いまスペインに旅行いくと水かけられる Barcelona anti-tourism protesters fire water pistols at visitors (CNN)


FENS2026はMadridらしい


池の平ホテル



Editorial Notes


「白樺リゾ～ト～池の平ホテル♪」のCMでおなじみの池の平ホテル、実家のわりと近くですが行くのは初めて。涼みながらデスクワーク出来そう (北沢)


シンポジウム盛会を祈念しております！しかし2年でこんなに進んでるの流石すぎます(脇)


福岡でお会いしましょう。「NR聴いてます」ではなくて「論文読みました」(隠語)といって声かけてください(萩)

UC Irvineの五十嵐啓さん(@kei_m_igarashi)再登場。転職活動振り返り、次に出る論文のSneak peek (詳細はNeuro2024のセッションにて)、R01グラント審査の実際＆それを踏まえた書き方戦略講座、若い人へのメッセージなど (7/6 収録)



Show Notes (番組HP):


五十嵐さんラボ
五十嵐さん回 1 2,3 4
Richard Tsien
Paul Glimcher Neuroeconomicsの教科書に結構影響をうけたので残念...(萩)
Nicolas Tritsch
この前Nature出てた
坂野先生
2020と2021に出た論文
尾藤先生＠Committee Chair
Hannah Monyer
北村さん
最初の大学院生がPhDを取った
Heechul Jun
Jason Lee
横山先生(pdf)
山本先生
吉田豊さん
内田さん
加野真一さん
森下博文さん
Attila Losonczy
Hard money vs Soft money (pdf)
ノルウェーのボス
学士院の賞
訴訟に関する記事 訂正：BrandeisではなくTufts
井上夫妻回 1 2 3 4
千歳さん回
五十嵐さんのジョブハントメモ
Bonhoefferの論文
Earl Miller
五十嵐さん達のNeuro2024でのセッション
Rbp4-creなどについてのGENSAT論文
MECからのPerforant PathをLesionするとCA1のPlace Cell場所受容野が曖昧になる　※ただしGrid Cell阻害実験の解釈は分かれている？：Leutgebのこの辺りの論文 1 2
海馬からの興奮性入力がGrid cellの発火パターン形成に必要
伊藤さん
のNucleus Reuniensの仕事
MECの恐怖記憶への関与を調べた北村さんの仕事 その続報  prefrontalの関与
Hongjun Song
藤澤さん
Antonio Fernandez-Ruiz
Noah Gray
ASCONA meeting
Robert Datta
Shohei Furutachiさん回 1 2
Lake Conferences
Gordon の Basal Ganglia
彦坂先生
金子先生
松田先生
のJN
柳下先生
北欧のドーパミン学会IBAGS
Dayan
Gordon の Frontal Cortex
Bruce McNaughton
40 Hzの話
アナベル
Li-Huei Tsai
Buzsakiが出したああいう論文
Gordon のNeurobiology of Cognition
Desimone
宮下先生
Brain Initiative 40 % カット
NIA
NIMH
Early Stage Investigator (ESI) Policies
LMDNのスタディセクション
NIH RePORTER
小宮山先生
CDIN
NSF
Lake ConferenceのDisease focusedな回
Menno Witter
Ted Jones
安田先生のブログポスト
NIHのeRA commons
参考：R01で査読者から貰うサマリーステートメントの例 (某ラボの公開gdocs)
参考：R01アプリケーションのサンプル (pdf)
PO: Program Officer
U01
P
Ivan Soltesz
Gary Lynch
海軍のグラントOffice of Naval Research
神経科学の達人での講演
薬理行動薬理若手研究者の集いでの講演
本庶先生の私の履歴書
羊土社の留学対談その１　その２
日本学生支援機構の海外留学支援制度

Editorial Notes:


前回話させてもらったのがついこの前のように感じるのですが、3年も経ったとは。月日が過ぎるのはあっという間ですね。宮脇さん萩原さん、NeuroRadio三年間お疲れさまでした。研究者というのは楽しくも、つらく苦しい人生だと思っていましたが、テニュアがもらえると心の安寧が得られ、見える景色がだいぶ変わってきます。でも、人生で一番ダイナミックだったのは大学院生・ポスドク時だったのも事実です。みなさん、今を頑張ってください！Carpe Diem!! (五十嵐)
非公開アフタートークも楽しかったです、五十嵐さんありがとうございました！(脇)
カレルは「俺は人生で一度もテニュア持ったことないぞ」っていつも偉そうに言ってます(萩)

Northwestern Universityで来年1月から独立する千歳雄大さん(@yutasenzai)さんがゲスト。BuzsakiラボでのPhD、Scanzianiラボでのポスドク、ジョブハントで苦労したこと、独立後の研究計画について伺いました (6/20 収録)


Show Notes (完全版)：


千歳さんラボHP
Scanziani lab
Buzsaki lab
千歳さんに部屋を貸してもらった回
河野憲二先生
小川正先生
成宮周先生
古屋敷智之先生
Michela Gallagher
Denis Pare
ユーリ: ブザキのこと
藤澤先生
水関先生
Eran Stark
OLM cell specificなCreライン
PhD時代の論文その１：Mossy Cellの論文
DRD2-creでMossyがラベルできる、の論文
POMC-creでGCラベル、の論文
NeuroNexusのBuzsaki シリーズを含むカタログ(pdf)
電気生理的な特徴でGranuleを分離する、の論文 ”To our knowledge there are no electrophysiological characteristics with conclusively identify a neuron as a granule cell. In conclusion, it will be necessary in future work to use mode refined neurophysiological criteria combined with anatomical marking techniques for classification of dentate units.”
B2B2BになったLosonczyの論文とKnierimの論文
PhD時代の論文その２：V1で層の特徴量を見つけた論文
Antonio Fernandez-Ruiz
Shawn Olsenの論文
ポスドクでの仕事
SC-postrhinalを調べた論文
Mu-ming PooとYang DanのActivity recall論文
Adrien Peyrache
の、REM睡眠中Head Directionシステム論文
Robert Wurtz
による、サッケードを生み出す回路のレビュー
Roger Nicoll
Pontine waveとREM
Gilles Laurent
Reptileにおけるmidbrainのinterhemispheric competitionへの関与
井上夫妻のZoomミーティングに関するアドバイスの回　およびノート
Feinberg School of Medicine
2pImagingは結構decodingできる (from 大木研)
西本さん
神谷さん
睡眠中のGrid cellとHDとのcoordination



Editorial Notes:


今回はこのような機会を頂き大変ありがとうございます。僕自身、大変楽しませて頂きましたし、これまでのことやこれからのことを考え直すいい機会にもなりました。Northwestern大学で来年1月からLaunchする研究室では、一緒にサイエンスを楽しんでくださるポスドク、学生、ラボテクを絶賛募集中ですので、興味があればいつでもご連絡ください！（千歳）
日常会話で海馬の豆知識を出せるようになりたい (脇)
なんでデニパレさんのとこには行かなかったのかをきくのを忘れました (萩原)

TED風トーク、DIY引っ越し、ライティングとLLM、買って良かった某アイテムについて雑談。後半は初のおたより回 (4/18収録)

Show Notes (番組HP):

雑談パート


Doudna
TEDに出た
神経科学学会にDoudnaが来た
U-Haul
DeepL Write
2021のIntercalated cluster論文
ChatGPT
Claude
Nature系列がやってる校閲サービス
Paperpile
Tushy
Totoの携帯用Washlet
シュピューラー

おたより紹介パート


押尾学
重要度と緊急度のマトリックス
ビジネス書
論文は常に書いていくもの、の出典
を書いたGeorge Whiteside
岡本太郎的な
Trachtenberg
ScanzianiがNeuronに出した
Yang DanからNature
Mriganka SurからNature
加藤さん回
のChR構造論文
佐野さん回
あやかさん回
研エン
神谷先生
発火頻度のログノーマル分布
Alison Barthのやつ
Toroidal回
GEVI回
Kilosort4論文
牧野さん回
サットン本
藤島さん回
麻しんワクチン接種について（Q７）
ロジスティック曲線ではなくロジスティック写像でした

Editorial Notets:


優しいおたよりばかりでホッととしました (脇)
健康のために12月にあるハーフマラソンにエントリーしました。スキーシーズンinしたときには既にいいコンディションという利点も。というわけで有酸素もやります。(萩)

健康診断、３年めのタックスリターン、グリーンカード取得、万年筆と競技ペン回しについて雑談。文献紹介は、RNAで認識部位をプログラム可能なリコンビナーゼ、プローブのPhotoswitchingによるアーティファクト、軸索ミトコンドリアはATPを消費する、のプレプリント (3/10収録)

Show Notes (番組HP):


たち：白子 (英語メニューだとSoft Roeって書いてあってFish Spermじゃないんだな、と思うなど)
コメント募集！のGoogle Form
Querie.me
3年めのJ1ポスドクのタックスリターン
IRSのExemption 記述その１ vs  記述その２
SPRINTAX ReturnsとCalculus
税金計算ソフトのチャットボット間違えまくり、の記事
7000ドル追加徴税の回
日米租税条約第２０条廃止について：1,2年めも米国源泉所得がある場合は徴税対象っぽい？
JHUがまとめたフェローシップリスト
NIHグラントのEligibility
USCIS: 米国市民権・移民業務局のこと
Jetstreamの芯が国際規格に　６年前でした
宮脇が使っているLAMY の万年筆
Faber‐CastellのE-Motion all black
萩原さんが想定していたLAMYの万年筆　(サファリ)
ゲルト・ミュラーがデザインしたBraun sixtant SM 31とLAMY 2000
ペン回しの技一覧
さらさら系のJetstream対抗馬はゼブラのサラサでした。
ぺんてるのシャープレット クリップを取り外せるのはシャープレット"2"でした。

文献紹介パート


一報目：Bridge RNAs direct modular and programmable recombination of target and donor DNA
Arc Institute
Patrick Hsu
Silvana Konermann
西増先生
マイクロスケール熱泳動
Evo
二報目：Comment on ‘Accumbens cholinergic interneurons dynamically promote dopamine release and enable motivation’
Nicolas Tritsch
Mohebi et al のAccumbens cholinergic interneurons dynamically promote dopamine release and enable motivation
Frenemy
Bernardo Sabatini とTritschのb2b nature
Dana et al.,のjRCaMP1a, bとjRGECO1a Fig2-Supple3,4がPhoto-switchingのFig
Erratum (出版社側のミスの訂正)というよりはCorrigendum(著者側のミスの訂正)でした
SchultzのRPE
メンデル捏造？に関する議論のまとめ
赤色dLight
Mohebi & Berke のNature論文
Azcorra et al., Awatramani と Dombeckの論文
内田さんの論文
最近Stephan Lammelが出したNature Neuroの論文
一人で訂正これでこれを訂正したと思っていましたが、
自己訂正というよりかは、StuberとDAT-Cre vs Th-Cre でやり合っていた感じでした
Voltage IndicatorのPhotoswitch
IRを一緒に当てると褪色が遅くなる
Kaede
CAMPARI
X-CAMP R
RCaMP3 Nature Methodsに掲載 (3/21)
初代mScarlet
Kaesarのドパミン軸索でのaction potential initiation by Cholinergic input
Stephanie Cragg
三報目：Most axonal mitochondria in cortical pyramidal neurons lack mitochondrial DNA and consume ATP
平林先生
Bio-stationさんのポッドキャスト
Franck Polleuxラボ
田尾さんのミトコンドリア局在と軸索分岐の論文
もう一報出てたやつ：Polleuxラボからでした
本来のScanning Ion Conductance Microscopy
SypHer
iATPSnFR



Editorial Notes:


ボストン唯一の万年筆専門店がつい最近閉業したらしい。惜しい (脇)
引越し全部自分でやったので結構大変でしたが無事終わりました。まだ新居全然片付いてないですが、広くなって嬉しいです。万年筆を眼球に..はジョジョ3部ですが誰にも伝わってなさそう(萩)

北京脳科学研究所の大久保達夫さんゲスト回。工学部からシステム神経科学に進んだきっかけ、FeeラボPhD時代、WilsonラボPD時代、現在のデータ解析を中心とした働き方の狙い、専門の分業に関するディスカッション、等 (12/30 収録)



Show Notes (完全版):


大久保さん個人HP
吉良さん@Chris Harvey Lab
計数工学科
Michael Fee lab
FeeラボでのNature論文
の日本語版解説
FeeラボでのNeuron論文
の日本語版解説
Rachel Wilson lab
Neuron論文
Pattern RecognitionとMachine Learning (PRML)
パターン認識の教科書の表紙
Parallel Distributed Processing (PDP): 並列分散処理で認知機能を説明しようとする1980年代に流行ったUCSDを中心とする認知科学のグループ。
Paul Churchland の本The Engine of Reason, the Seat of the Soul
Patricia Churchland
Mark Churchland
Anne Churchland
Terrence Sejnowski
The Computational Brain
Dmitriy AronovのScience論文（HVC破壊してもSubsongは残る）
COSYNE
Temperatureのやつ
鳥の歌生成に関わる脳領域、RA、HVC、LMAN の関連など
Jesse GoldbergのDopamineがPerformance errorをコードしている論文
親の歌を聴かせなかった時のHVCのシーケンス活動
Galen達がミニスコープを作ってカルシウムイメージングを始める
Genetic Dissectionのレビュー論文 2008
Andreas Luthiと David Anderson のb2b 2010
ハエはニューロンが個体を越えてIdentifiable: 仕事としては逃避を司るgiant fiber interneuronというのが古くから知られていて一番有名ですが、このニューロンは巨大なので例外で、ほとんどのタイプはsplit-Gal4のラインが整備されて以降（ここ10年）解析できるようなってきました。以下の仕事が代表的な例として挙げられます。



麻生さんのキノコ体の神経解剖、光遺伝学の仕事
並木さんの下降性ニューロンの仕事



実際split-Gal4作りがうまくいくと（２つのGal4ラインのうまい組み合わせが見つかると）、麻生さんの論文のFig. 2のように左右に一つずつあるニューロンが綺麗に取れてきます。一旦split-Gal4ラインができてしまえば、GFPを発現させてパッチしたり、オプトで活動を操作したりと、単一ニューロンレベルで解析できるのが良いところです。もちろん一つのセルタイプに複数のニューロンがあることもあるので、その場合は同じセルタイプ内では区別はできませんが（大久保）
ちなみにこのビデオがhemibrainというEMのデータから再構築されたニューロンのギャラリーで、一個のcell typeに名前がついていて、ユニークな形をしているのが分かりやすいと思います。このユニークな形のおかげで、EMのデータとsplit-Gal4を作る際に撮った光学顕微鏡のデータのマッチングは非常にうまくいっていて、同じニューロンを両方のデータで見つけられます（大久保）
髭さんのキノコ体の電気生理の仕事
並木さんの下降性ニューロンの仕事
ハエのConnectome論文 Central Brain Whole Brain
大学院生がやった行動実験の仕事（嗅覚と風を検知する機械受容覚にコンフリクトがあった場合、機械受容覚に従う）
Vivek Jarayaman
の仕事
ハエDual Patch, 隣の大学院生がやった運動に関するニューロンのdual patchの仕事
ハエのTriple Patch: このWilson研の大学院生の仕事のFig. 4ではシナプス結合している３つのニューロンからのin vivo同時記録という超絶技巧あり！
Janeliaがハエのラインをリリースした（Split-Gal4）
風間さん
Wade Regehr
Bernardo Sabatini
Chri