医学遗传前沿

senzhao

聚焦医学遗传与人类遗传的最新进展, 关注遗传学在医药卫生市场中的价值。 讨论学术问题,探索转化机遇。 解析遗传密码,促进人类健康。

  1. -6 ДН.

    EP37 表观遗传+机器学习辅助遗传病诊断

    在本期节目中,由我为大家介绍DNA甲基化与机器学习在遗传病诊断中的应用。 从基础的表观遗传调控讲起,到机器学习如何帮助分析数百万个CpG位点,我们会一起了解人工智能如何改变临床诊断的精准度与速度。本期节目还特别介绍了 EpiSign平台——一种利用甲基化“表观指纹”辅助罕见病诊断的创新技术。它通过机器学习算法分析血液DNA甲基化模式,已能检测两百余种先天性神经发育障碍,显著提高了诊断率。我们也将讨论它的工作机制、临床成效、局限性,以及未来在表观遗传病、癌症早筛中的潜力。 参考文献EpiSign网站:https://epigen.ccm.sickkids.ca/ 和嘉琦师兄合作的 cfDNA 甲基化 paper:10.1186/s12943-021-01330-w 三代测序甲基化分析:10.1038/s41576-025-00822-5 术语列表表观遗传学 Epigenetics 研究在不改变DNA序列的情况下,基因如何被开启或关闭的学科。就像同一本说明书,不同人有不同的“阅读方式”。 DNA甲基化 DNA Methylation 在DNA的胞嘧啶(C)上加上甲基(–CH₃),形成“开关”,决定基因是否被表达。是最经典的表观遗传修饰之一。 CpG位点 CpG Site DNA中一个C和一个G相邻的位置,是甲基化最常发生的区域。可理解为基因调控的“关键节点”。 表观签名 / 表观指纹 Episignature 一种疾病特有的甲基化模式,像“指纹”一样可用于识别特定病症。EpiSign平台正是基于这种特征。 神经发育障碍 Neurodevelopmental Disorder (NDD) 一类影响脑部发育的疾病,如智力障碍、自闭症、发育迟缓等。部分由基因或表观遗传异常引起。 意义不明变异 Variant of Uncertain Significance (VUS) 在基因测序中发现的变异,尚不清楚是否与疾病有关。EpiSign通过甲基化特征帮助重新评估这些变异。 支持向量机 Support Vector Machine (SVM) 一种常用的机器学习算法,用于分类任务。EpiSign使用SVM模型区分不同疾病的甲基化模式。 DNA甲基化芯片 DNA Methylation Microarray 一种检测几十万到上百万个CpG位点的实验工具,如Illumina EPIC芯片,用于EpiSign的数据收集。 批次效应 Batch Effect 不同实验批次或检测平台间产生的系统性误差,会干扰机器学习模型的准确性。 Agentic AI / 智能代理 Agentic AI 一种能自动执行分析、解释和报告生成的AI系统,未来或可自动完成整个甲基化诊断流程。 MethylGPT / 甲基化大模型 MethylGPT 类似ChatGPT的基础模型,但专门训练于甲基化数据上,可用于泛化预测或新疾病发现。 cfDNA / 循环游离DNA Cell-free DNA 存在于血液中的游离DNA片段,可反映体内细胞状况,常用于癌症早筛和非侵入性产检。 EPIC芯片 Illumina Infinium EPIC Array 当前主流的DNA甲基化检测芯片,覆盖约85万个位点,EpiSign和EPICUP等检测均基于它。 亚硫酸氢盐处理 Bisulfite Conversion 实验步骤:将未甲基化的C转为U(最终为T),以便区分甲基化与未甲基化位点。 若对播客有任何问题或者投稿,或需要获得文字版音频总结,请联系我 zhaosen830@gmail.com,小红书/微博:@撸森森 同时也可以添加微信zhaosen830进入听友交流群,谢谢Thanks♪(・ω・)ノ

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  2. 15 СЕНТ.

    EP35 细胞遗传学的继往开来@王昊

    本期节目,我们请到了来自浙江大学医学院附属邵逸夫医院妇产科的王昊教授,跟大家一起聊一聊细胞遗传学的历史与前沿进展,尤其是近期更新的ISCN (An International System for Human Cytogenomic Nomenclature)指南,帮助医学遗传检验相关的同事和老师遵循最新的国际标准进行临床报告和科研文章撰写~ 专业名词与缩写中英文列表 Cytogenomics细胞基因组学研究染色体结构与基因组功能之间关系的学科。 G-band (Giemsa banding)G显带利用姬姆萨染色对染色体进行条带分析的方法。 R-band (Reverse banding)R显带与G带相反的条带染色方法,常用于观察端粒区域。 FISH (Fluorescence in situ Hybridization)荧光原位杂交利用荧光标记探针检测染色体或DNA片段特定位点。 Hi-C (Chromosome Conformation Capture with high throughput sequencing)染色质构象捕获测序(Hi-C)用于研究基因组三维空间结构的技术。 ISCN (An International System for Human Cytogenomic Nomenclature)人类细胞基因组学国际命名体系国际通用的染色体核型与核型异常描述标准。相关链接《人类染色体异常核型图谱》内容介绍及购买链接:https://mp.weixin.qq.com/s/CocPLluH22FbMCqKjNwl-w ISCN 在线课程:https://mp.weixin.qq.com/s/qFOilbxlO0tBVqek_nwo3g ISCN 小贴士鼠标垫:#小程序://微店买买/hzXH135qIakRG4A 王昊教授微信公众号:昊哥的遗传视界 若对播客有任何问题或者投稿,或需要获得文字版音频总结,请联系我 zhaosen830@gmail.com,小红书/微博:@撸森森 同时也可以添加微信zhaosen830进入听友交流群,谢谢Thanks♪(・ω・)ノ

    43 мин.
  3. 2 ИЮЛ.

    EP32 CRISPR定向进化与遗传病的基因治疗@杨添

    本期节目,我们请到了来自美国 Life Edit Theraputics Inc.的杨添博士,一起聊一聊在美国 Biotech 的职业发展,CRISPR 基因编辑技术,定向进化技术, 以及遗传病的基因治疗~ 主要内容02:19 在学术界和工业界中如何选择 04:28 美国 Biotech 的生态与职业发展 11:16 CRISPR 技术的背景介绍 14:03 CRISPR 技术的迭代 18:13 Base editing 的定向进化 25:35 遗传病的基因治疗案例 关键词与相关链接CRISPR背景介绍 :https://www.youtube.com/watch?v=7ESZTE6rjLI Classcal CRISPR 与迭代新技术 Classical CRISPR (CRISPR 1.0): Double-strand break https://ir.editasmedicine.com/news-releases/news-release-details/editas-medicine-announces-strategic-transition-vivo-gene-editing https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2309915 https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-approves-first-gene-therapies-treat-patients-sickle-cell-disease https://www.biospace.com/business/crisprs-casgevy-on-the-rise-with-more-gene-therapy-proof-of-concept-to-come-in-2025 https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2309149Base Editing (CRISPR 2.0):https://www.youtube.com/watch?v=B1Bv-UmxugM Prime Editing (CRISPR 3.0):https://www.youtube.com/watch?v=huDgW0wCi9c Large Insertion, RNA Editing (CRISPR 4.0): Tome:https://www.fiercebiotech.com/biotech/young-gene-editing-biotech-explores-strategic-options-investors-pullback Tune:https://tunetx.com/tune-therapeutics-presents-first-data-supporting-tune-401-a-first-in-class-epigenetic-silencer-for-hepatitis-b/  遗传病的Base editing治疗案例: https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2504747 10.1038/s41588-025-02172-8 若对播客有任何问题或者投稿,或需要获得文字版音频总结,请联系我 zhaosen830@gmail.com,小红书/微博:@撸森森 同时也可以添加微信zhaosen830进入听友交流群,谢谢Thanks♪(・ω・)ノ

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